Специалист по структурной биоинформатике

Описание

Тельная Елизавета Андреевна
Ботаническая 64/2 Петергоф, Санкт-Петербург
+7 (950)-008-06-96
serlina1624@gmail.com
Дата рождения: 06 февраля 1998
Гражданство: Россия
Образование
2015 – 2019: Бакалавриат, Санкт-Петербургский государственный университет,
физический факультет, кафедра молекулярной биофизики и физики полимеров.
2019 – 2021: Магистратура , Санкт-Петербургский государственный университет,
физический факультет, кафедра молекулярной биофизики и физики полимеров.
2021 – 2023: Магистратура, НТУ “Сириус”, биоинформатика и вычислительная
биология.
С 2021 года аспирант физического факультета СПбГУ. Кафедра молекулярной
биофизики и физики полимеров.
Опыт работы
Санкт-Петербургский государственный университет, 2019, Лаборант-исследователь,
работа в рамках гранта РНФ№ 16-13 -10090 Люминесцирующие нанокластеры
металлов в нуклеопротеиновых матрицах.
 Обязанности: приготовление растворов, постановка форезов, получение
спектров люминисценции.
Дальневосточный федеральный университет, 08.2022, Старший инженер, работа в
рамках студенческой практики.
 Обязанности: поиск последовательностей в базах данных NCBI, BLAST,
обработка данных NGS ( BWA, Bowtie2, SPAdes, Trinity, QUAST, BLASTn,
Trimmomatic, FastQC, CD-HIT, MAFFT, IGV ). Написание пайплайна обработки
данных секвенирования.
Навыки
С осени 2016 года занималась научными исследованиями в лабораториях СПбГУ, в
рамках гранта РФФИ №18-08-01500 “Механизмы самосборки надмолекулярных
структур на основе архитектурных белков хроматина” 2017-2020.
Из лабораторных методов более всего освоила ИК-спектроскопию (в том числе и
НПВО), также электрофорез в ПААГ, УФ-спектроскопию. В процессе учебы также
получила практические навыки по атомно-силовой микроскопии, ЯМР,
рентгеноструктурному анализу.
На теоритических занятиях разбирала принцип работы таких методов исследования,
как масс-спектрометрия, седиментация, двойное лучепреломление, малоугловое

рассеяние. В период обучения работала в таких программах как MATLAB, Labview,
Rstudio.
В 2020 году проходила стажировку в зарубежном университете (KAUST). Работала с
клеточными культурами, получила навыки в наработке и очистке белка (афинная
хромотография, гель-фильтрация, ПЦР). Также получала и обрабатывала данные по
FRET спектроскопии. За это время сильно подтянула английский, в том числе и
профессиональные термины.
С 2021 года занимаюсь биоинформатикой. Тема диссертации - пайплайн для
обработки данных NGS дуплицированных геномов. Также в процессе обучения
получила навыки по структурной биофнформатике: GROMACS, ESPResSO, rosetta,
FoldX, AutoDock Vina (также есть некоторые навыки по докингу). Визуализировала в
VMD, PyMol. Работала с пакетами python, такими как: rdkit, modeller, nglview, mdtraj.
Проходила курсы по работе с реляционными базами данных (SQL), есть начальные
навыки по работе с С++ и Java. Для второй магистрской диссертации пишу скрипты на
python и bash. Немного оринетируюсь в машинном обучении (SciPy, TensorFlow,
PyTorch, Scikit-learn, Seaborn, Pandas). Умею работать с Git.
Публикации и конференции
Участвовала во многих студенческих конференциях и школах, есть несколько научных
публикаций.
Профиль автора в РИНЦ: 1152524
Профиль автора в SCOPUS: 57213147838
Дополнительные сведения
Во время учебы была членом студенческого совета, представляла интересы студентов
в учебно-методической комиссии факультета. Участовала в организации множества
мероприятий в университете и на факультете (мероприятия на ~1000 человек), и как
волонтер и как главный организатор. Получила опыт публичных выступлений.
Коммуникабельна, умею быстро улаживать конфликты и координировать работу
команды.
Уровень английского B2.